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DataDirect Networks > 实例探究 > 加速:生命科学 - 堪萨斯城儿童仁慈医院利用高性能 DDN 存储实现快速基因组测序,将危重儿童实现重大医学突破的时间缩短了近 2 倍
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ACCELERATE: LIFE SCIENCES - Children’s Mercy Kansas City Reduces Time to Achieve Major Medical Breakthroughs for Critically Ill Children by Nearly 2x with Rapid Genome Sequencing Powered by High-Performance DDN Storage

技术
  • 基础设施即服务 (IaaS) - 云存储服务
适用行业
  • 医疗保健和医院
适用功能
  • 产品研发
用例
  • Condition Monitoring
  • 预测性维护
服务
  • 数据科学服务
挑战
堪萨斯城儿童仁慈医院是一家领先的儿童医院,它运营着世界上第一个儿科全基因组测序中心。该医院的儿科基因组医学中心与各种专业人员合作,对罕见遗传疾病进行测序和分析。然而,基因测序是非常计算密集型和数据密集型的,这给中心的 IT 团队带来了越来越大的压力,需要提供充足的处理能力和高性能的数据存储,以支持基于全基因组测序和全外显子组测序的测试。该中心之前部署了 EMC Isilon 存储,最初满足了他们处理临床和研究工作流程的存储需求。然而,随着时间的推移,儿童仁慈医院传统的横向扩展 NAS 存储缺乏性能和容量的可扩展性,无法满足苛刻的数据创建和访问需求。
关于客户
堪萨斯城儿童仁慈医院是一家领先的儿童医院,拥有世界上第一家儿科全基因组测序中心。在该医院的儿科基因组医学中心,医生与临床实验室科学家、分子遗传学家、生物信息学家和软件工程师合作对罕见遗传疾病进行测序和分析。2012 年,《时代》杂志将该中心的快速基因组图谱测试 STAT-Seq 评为年度顶级医学突破,因为它可以在两天内从头到尾解码基因组,而这个过程通常需要六周或更长时间。该中心致力于开发下一代医疗治疗的临床测试,以改善儿童仁慈医院和世界各地患者的治疗效果。
解决方案
儿童仁慈医院部署了具有 1PB 横向扩展存储的 DDN GS7K®,以满足性能、并行 I/O 和容量要求。DDN 的 GRIDScaler® 平台将业界领先的性能和密度存储与基于 IBM® Spectrum Scale™ 的并行文件系统相结合,非常适合支持该中心的全方位临床和研究工作流程。DDN 无缝地提供了高性能和协作环境的完整端到端数据管理。DDN 的 GS7K 还为儿童仁慈医院提供了理想的外形尺寸,在其小型数据中心空间内提供高密度存储,并能够以简单的方式扩展容量。该中心还在探索扩展其 DDN 存储的机会,以巩固其在儿科转化研究领域的领导地位。
运营影响
  • The time to perform its STATSeq rapid genome test has reduced by about 43% from 2.5 to 1.75 hours.
  • Ingest from the Center’s Illumina sequencers has increased significantly.
  • The DDN GS7K scales easily and seamlessly to support the processing needs of the Center’s software tools.
数量效益
  • Time to perform its STATSeq rapid genome test has reduced by about 43% from 2.5 to 1.75 hours.
  • Ingest from the Center’s Illumina sequencers has increased significantly.

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