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Altair > 实例探究 > 转化基因组学研究所 (TGen) 的 Altair PBS Professional™:加速基因组发现
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Altair PBS Professional™ at the Translational Genomics Research Institute (TGen): Accelerating Genomic Discoveries

技术
  • 基础设施即服务 (IaaS) - 云计算
  • 处理器与边缘智能 - 嵌入式操作系统
适用行业
  • 生命科学
适用功能
  • 维护
  • 产品研发
用例
  • 现场人员安全管理
  • 时间敏感网络
服务
  • 系统集成
挑战
转化基因组学研究所 (TGen) 需要一个供应商支持的解决方案,可以在其 512 节点生产集群 Saguaro 上提供灵活的作业调度。 TGen 的使命是将人类基因组知识转化为治疗和诊断,这是一项需要大量计算资源的任务。该研究所建立了高性能生物计算中心 (HPBC) 来提供这些资源,但他们需要一种解决方案,能够处理跨多个节点的大型作业的调度,同时还能在单个节点上运行数千个小型串行作业。该解决方案还需要易于安装,并且几乎不需要支持。
关于客户
转化基因组学研究所 (TGen) 是一个由亚利桑那州、亚利桑那州市政府、印第安部落社区、教育机构、私人基金会和企业实体共同创建的非营利组织。 TGen 的使命是将人类基因组知识转化为治疗和诊断学。为了实现这一目标,TGen 建立了高性能生物计算中心 (HPBC),以提供发现遗传变化如何影响疾病进展和治疗耐药性所需的计算资源。 TGen 在 Saguaro 上拥有大约 65 个账户,其中大部分在 TGen 内部,但也包括亚利桑那州立大学和其他研究机构的科学合作者。
解决方案
TGen 选择 Altair 的 PBS Professional 是因为其灵活性和安装简便性。 PBS Professional 能够满足 TGen 的需求,能够在多个节点上运行大型作业,同时还在单个节点上运行数千个小型串行作业。该软件易于安装,几乎不需要任何支持,这使其成为 TGen 的理想解决方案。 PBS Professional 还提供会计功能,使 TGen 能够跟踪运行的作业数量以及每个作业所花费的时间。展望未来,TGen 计划升级到 PBS Professional 的新版本,该版本提供作业阵列、冗余和故障转移等功能。这些功能将帮助 TGen 应对对 Saguaro 资源不断增长的需求。
运营影响
  • The implementation of PBS Professional has greatly improved TGen's ability to manage its computational resources. The software's flexibility allows TGen to run large jobs across multiple nodes while also running thousands of small serial jobs on a single node, maximizing the utilization of Saguaro's resources. Additionally, PBS Professional's accounting capabilities provide TGen with valuable insights into the usage of its resources, enabling the institute to make informed decisions about resource allocation. Looking ahead, TGen plans to upgrade to a newer version of PBS Professional, which offers features such as job array, redundancy, and failover. These features will help TGen handle the increased demand for Saguaro's resources and ensure that the institute can continue to make important genomic discoveries.
数量效益
  • PBS Professional was easy to install and required little to no support.
  • PBS Professional provides the flexibility to run large jobs across multiple nodes while also running thousands of small serial jobs on a single node.
  • PBS Professional's accounting capabilities allow TGen to track the number of jobs run and the amount of time each job takes.

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